Образовался Ипшарский каньон в результате тектонического движения земной коры. В недрах вот этой горы происходят трещины, в эти трещины попадают грунтовые воды, осадки, которые постепенно её размывают, механически её разрушают и физически растворяют.
В частности над каньоном Ипшара поработала река, которая первоначально текла по поверхности горы, она то его и постепенно стала размывать, и получился такой вот красивый и живописный каньон.
